Tiens, c'est ce que je suis en train de faire !
Pour faire ceci, j'utilise romcenter, un peu moins puissant que CMP, mais plus simple.
Etapes :
1 - Tu recupère les DAT CPS1, CPS2, NeoGeo et WinKawaks pour Romcenter.
2 - Tu colles toutes tes roms dans le meme repertoire (ex : c:\roms\encours)
3 - Tu lance Romcenter et tu te parametre le set CPS1 et tu mets 2 répertoires : ton repertoire encours et ton repertoire de destination (c:\roms\cps1)
4 - Tu supprime de l'affichage les roms inconnues (en gris) tu selectionne toutes tes roms cps1 (ce qui reste) et tu fais un clic droit->Deplacer.
5 - Tu refais tout ca pour CPS2 et NeoGeo
Une fois que tu as fini, tu peux configurer le DAT Winkawaks pour romcenter avec tes trois repertoires et vérifier le tout (checksums, noms etc,etc).