Si j'ai bien compris, tu peux booter sur une disket, partitionner & formater le disk mais pas démarrer dessus.
un truc tout bête,
as-tu change la nappe IDE, j'ai déjà eu un soucis similaire avec un lecteur de disket, après examen la nappe était legerement abimé sur quelque fil au milieu...
Il se peut aussi que le boot secteur ( secteur d'amorçage du disk ) soit hs